Пенчо Пандъков е еколог и хидробиолог. Упражнява свободна професия като биолог. Работи като експерт в управлението на водите и опазване на биологичното разнообразие. Участва в редица международни проекти в сферата на околната среда. Дейно се включва в природозащитни борби и начинания, както и в образователни  дейности за деца и младежи на екологична тематика.